Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TUBA3CQ13748 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TUBA3CQ13748 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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