Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTCH1Q13635 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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