Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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