Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SP140Q13342 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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