Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms