Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKRN3Q13064 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKRN3Q13064 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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