Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GRIK2Q13002 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms