Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRJQ12913 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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