Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN2AQ12879 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
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