Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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EFEMP1Q12805 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFEMP1Q12805 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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