Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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