Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms