Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA3Q08378 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA3Q08378 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms