Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms