Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms