Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms