Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRB3Q04118 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms