Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRF8Q02556 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms