Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms