Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEX3Q00994 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEX3Q00994 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms