Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms