Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO4P61968 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms