Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERV-K104P61576 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms