Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVK11-1P61568 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVK11-1P61568 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms