Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARF3P61204 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms