Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms