Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK4P57078 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK4P57078 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms