Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF4P48230 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms