Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms