Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACADSBP45954 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms