Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA4P35212 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA4P35212 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA4P35212 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA4P35212 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms