Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPS1P31327 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPS1P31327 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPS1P31327 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPS1P31327 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPS1P31327 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CPS1P31327 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPS1P31327 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms