Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGA1P29973 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGA1P29973 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGA1P29973 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGA1P29973 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms