Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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