Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HRCP23327 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HRCP23327 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HRCP23327 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HRCP23327 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms