Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms