Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL1P22362 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL1P22362 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL1P22362 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms