Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNNI3P19429 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms