Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATF3P18847 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms