Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSPP15924 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSPP15924 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSPP15924 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSPP15924 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSPP15924 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms