Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VPREB1P12018 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms