Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DMDP11532 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DMDP11532 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DMDP11532 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DMDP11532 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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