Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms