Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms