Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms