Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP10P09238 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MMP10P09238 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP10P09238 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP10P09238 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP10P09238 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms