Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms