Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB1P08034 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms