Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHBP07195 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDHBP07195 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHBP07195 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDHBP07195 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDHBP07195 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms