Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms